NanoPlus包括尺寸和ζ势的温度梯度特征。这一独特的特性允许研究人员进一步利用内置的珀尔蒂埃热电控制器进行温度研究。NanoPlus中的样品电池可以保持在5°C到90°C之间的特定温度，或者以0.1°C或更大的幅度增加或降低温度梯度。这对于使用NanoPlus确定蛋白质的熔点或变性点非常理想。
要设置蛋白质分析的温度梯度，在尺寸SOP设计器中，将“测量参数”下的“手动温度设置”设置为“梯度”。然后填写“梯度温度(℃)”表，包括起始温度、结束温度、间隔和平衡时间，单位为秒。这个设置告诉NanoPlus收集每个温度点的大小数据，并将每个点作为单独的数据文件保存在“大小分析”数据库中。
分析完成后，软件还会自动生成“温度梯度分析”文件，该文件可以在“尺寸分析”下打开。该文件将具有最终的.TGR的温度梯度，并且在打开时，将显示尺寸（NM）与温度（°C）。累积分子值将用于尺寸点。
利用温度梯度函数对牛白蛋白血清(BSA)样品进行了测试。重复测试，在这两种情况下，发现熔点为68.0°C。
